1. Terselenggaranya pendidikan dan embelajaran berbasis kesatuan ilmu keislaman khas pesantren dan sains untuk menghasilkan lulusan yang profesional di bidang Agama Islam.

2. Terselenggaranya penelitian dan pengabdian kepada masyarakat bidang pendidikan yang memadukan ilmu keislaman khas pesantren dan sains yang bermanfaat bagi  pegembangan ilmu, dan peradaban Islam, pesantren dan masyarakat

3. Terwujudnya tatakelola kelembagaan pendidikan yang profesional.

4. Terjalinnya kerjasama bidang pendidikan dengan berbagai lembaga nasional dan internasional dalam rangka mengembangkan potensi tenaga pendidik.